شهین خاکپور توسط شعبه سوم بازپرسی بیدادگاه عمومی و ضدانقلاب بندرعباس به اتهام «اقدام علیه امنیت ملی از طریق تشکیل و عضویت در گروههای مخالف نظام»، «فعالیت تبلیغی علیه نظام به نفع گروههای مخالف نظام» و «توهین به رهبری» مورد محاکمه قرار گرفته است.
‌‌
این فعال مدنی روز هفتم مرداد ماه ۱۳۹۹ در پی دریافت احضاریه به شعبه سوم بازپرسی بیدادگاه عمومی و انقلاب بندر‌عباس مراجعه کرده و از آن روز تاکنون اطلاعی از وضعیت وی در دست نیست.
‌‌
شهین خاکپور پیش‌تر در تاریخ ۷ خرداد ۱۳۹۸ به دلیل اعتراض به حجاب اجباری و وضعیت معیشتی در کرمان بازداشت و به بازداشتگاه شیراز منتقل شده بود. این فعال مدنی پس از مدتی با پایان مراحل بازجویی به صورت موقت و تا پایان مراحل دادرسی از زندان آزاد شد.
‌‌
گفتنی است شهین خاکپور به دلیل فعالیت‌های مدنی سابقه دو بار بازداشت توسط نیروهای امنیتی را دارد.